Theo UBND TP.Đà Nẵng việc kéo dài thời hạn này làm ảnh hưởng đến đầu tư phát triển đô thị của thành phố. Cũng theo UBND TP.Đà Nẵng, cảng Sông Hàn (trực thuộc Cảng Đà Nẵng) nằm ở khu vực trung tâm thành phố có tổng chiều dài cầu bến 750 m, chuyên nhận vận chuyển hàng hóa đường sông. Cảng có diện tích hơn 10.000 m2 chứa hàng, chỉ có thể tiếp nhận các loại tàu vận tải dưới 5.000 DWT, tàu container với tổng công suất vài trăm ngàn tấn hàng hóa/năm cùng các loại tàu khách vừa và nhỏ. Năm 2012, UBND TP.Đà Nẵng đã có thỏa thuận đền bù cho Vinalines để thực hiện di dời, giải tỏa. Nhiều hạng mục công trình, vật tư thiết bị đã qua sử dụng vẫn được UBND TP.Đà Nẵng thanh toán đền bù trên 85% giá trị đầu tư. Nhà kho số 1 rộng 880 m2 của cảng Sông Hàn đã được tháo dỡ, di dời để lấy mặt bằng cho cuộc thi trình diễn pháo hoa quốc tế 2012.
Trước đó, vào năm 2011, tại kỳ họp thứ 3, HĐND TP.Đà Nẵng khóa VIII đã ban hành nghị quyết nêu rõ thời hạn "đến ngày 31.12.2012 thực hiện việc di dời cảng Sông Hàn, bàn giao lại mặt bằng để cải tạo, nâng cấp và chuyển đổi công năng thành cảng du lịch...". Tuy nhiên, tại Hội nghị thường niên của Hiệp hội Cảng biển Việt Nam - VPA, tổ chức tại Đà Nẵng vào tháng 8.2012, VPA cho rằng việc di dời cảng Đà Nẵng đã ảnh hưởng không nhỏ đến sản lượng hàng hóa thông qua cảng và đời sống cán bộ công nhân viên tại cảng Sông Hàn. Ngoài ra, Cảng Đà Nẵng cũng kiến nghị UBND TP.Đà Nẵng nhanh chóng hỗ trợ nguồn vốn di dời và giải tỏa đền bù.
Trong khi đó, tại cuộc họp thông qua một số đề án quy hoạch kiến trúc tại Đà Nẵng vào ngày 19.10, ông Nguyễn Bá Thanh, Bí thư Thành ủy, Chủ tịch HĐND TP.Đà Nẵng yêu cầu UBND TP.Đà Nẵng có công văn gửi Vinalines với nội dung: "Thông báo cho Vinalines biết theo Nghị quyết của HĐND TP.Đà Nẵng, đến ngày 1.1.2013, cảng Sông Hàn chuyển công năng thành cảng du lịch, không còn là cảng hàng hóa nữa". Đặc biệt, ông Nguyễn Bá Thanh nhấn mạnh: "Bắt đầu từ ngày 1.1.2013, TP.Đà Nẵng cấm tuyệt đối xe tải vào cảng Sông Hàn để giao, nhận hàng hóa. UBND TP.Đà Nẵng phải chỉ đạo Sở GTVT thực hiện đặt biển báo cấm phương tiện vận tải trên đường Bạch Đằng".